1721 Bau einer mechanischen Schleifladenorgel mit 26 Registern auf 2 Manualen und Pedal durch Orgelbauer Josef Bossard. 1797 Kloster wird durch franz. Truppen säkularisiert und als Unterkunft belegt. Zu dieser Zeit waren 5 Orgeln in der Klosteranlage vorhanden, 1 Hauptorgel und zwei Chororgeln in der Klosterkirche, 1 Positiv im Refektorium und 1 Positiv als Übungsorgel. Eine der Chororgeln gelangte in den Grand Temple in La Chaux-de-Fonds. 1956 Restaurierung der Klosterkirche. 2001 Als Interimsorgel wird die Metzler-Orgel mit 16 Registern auf 2 Manualen und Pedal aufgestellt, die Bernard Heiniger 1985 als Chororgel für den Temple du Pasquart in Biel hatte erbauen lassen. 2009 Rekonstruktion der Hauptorgel von Josef Bossard durch Orgelbau Kuhn AG, Männedorf. Die Spuren an den Wänden und der Empore und eine vollständige Beschreibung mit Disposition der historischen Orgel ermöglichten einen exakten Nachbau, siehe auch den Bericht von Orgelbau Kuhn zu dieser Rekonstruktion (pdf-Datei).

Klosterkirche, Hauptorgel Bellelay BE ____________________________________ Typ: Traktur: mechanisch Registratur: mechanisch Windladen: Schleifladen Baujahr: 2009 Einweihung: 6. Juni 2009 Orgelbauer: Kuhn AG, Männedorf Manuale: 3 + Pedal Register: 26 Manual I, C - c''', Positif kurze Oktave, Subsemitonien : dis/es, dis’/es’, dis’’/es‘‘ Bourdon 8 ' Principal 4 ' Flutte doux 4 ' Flageolet 2 ' Fourniture III 1 ' Cymbale II 1 ' Voix humaine 8 ' Tremblant Manual II, C - c''', Grand-Orgue, kurze Oktave, Subsemitonien : dis/es, dis’/es’, dis’’/es’’ Principal 8 ' Bourdon 8 ' Viole 8 ' Flutte sylvestre 4 ' Flutte traversiere 4 ' Viole d’amour 4 ' Quinte 3 ' Doublette 2 ' Fourniture IV 2 ' Gros Cymbale III 1 ' Cornet V (ab c‘) 8 ' Trompette 8 ' Clairon 4 ' Manual III, C – c’’’ Subsemitonien : dis‘/es‘, dis’’/es’’ Echo V (ab c‘) 8 ' Pedal, C - c', kurze Oktave Soubasse 16 ' Contre basse 16 ' Principal 8 ' Fagott 8 ' Sonderregister: Vogelgesang (St. François, bewegliche Figur auf dem Mittelturm im Prospekt) Koppeln, Spielhilfen: - Schiebekoppel I – II - Windkoppel II - P - Kalkantenanlage, 4 Keilbälge Stand: 2010